Celem współpracy w Euroregionie Pomerania jest podejmowanie wspólnych działań dla równomiernego i zrównoważonego rozwoju Regionu oraz zbliżenia jego mieszkańców i instytucji. Cele te można osiągnąć w szczególności poprzez:

• podnoszenie poziomu życia obywateli mieszkających w Regionie,
• popieranie idei jedności europejskiej,
• współpracę i wymianę grup społecznych, naukowych, zawodowych, kulturalnych oraz młodzieżowych,
• budowanie oraz dostosowanie infrastruktury do potrzeb ruchu granicznego i regionalnego,
• rozwój współpracy gospodarczej, wymiany know-how oraz transferu technologii,
• stworzenie kompleksowego systemu informacyjnego w celu wymiany danych w Euroregionie,
• wspieranie przy rozwiązywaniu problemów związanych z przekraczaniem granicy,
• współpraca w zakresie likwidacji pożarów i skutków klęsk żywiołowych.

Współpraca transgraniczna na terenie obecnego Euroregionu Pomerania istniała jeszcze przed jego utworzeniem. Powołanie wspólnej organizacji służącej koordynowaniu współpracy na pograniczu stworzyło nowe możliwości i ułatwiło zainteresowanym stronom podejmowanie odważniejszych działań.

Na co dzień współpracują ze sobą polskie i niemieckie służby mundurowe - policja, celnicy, straże graniczne, straże pożarne (np. OSP z Kołbaskowa, Smolęcina i Penkun), prokuratorzy, sędziowie, administracje rządowe, urzędy pracy, związki zawodowe, szkoły, organizacje młodzieżowe.

Od 1.10.1999 r. organizowane są wspólne polsko-niemieckie patrole straży granicznych. Współpraca Pomorskiego Oddziału Straży Granicznej z Federalnymi Urzędami Ochrony Granicy (BGSA) w Rostocku i Poczdamie oraz niemieckim Urzędem Celnym polega na wymianie informacji o tendencjach w ruchach migracyjnych uzyskanych z prowadzonych analiz, o transportach towarów znacznej wartości (np. alkoholu, papierosów, sprzętu RTV) oraz broni, amunicji i materiałów wybuchowych przekraczających granicę państwową, wspólnych szkoleniach, a także możliwości sprawdzania na terenie drugiego państwa danych o osobach i środkach transportu oraz na utrzymywaniu stałej łączności między polskimi i niemieckimi służbami na najniższym szczeblu strażnic i granicznych posterunków kontrolnych.

Do tradycji weszły już coroczne towarzyskie i rodzinne, wspólne festyny pod hasłem "Wspólnie pracujemy, wspólnie świętujemy" niemieckich i polskich pograniczników z przejścia granicznego w Pomellen-Kołbaskowie. Takie sportowo-towarzyskie spotkania polskich i niemieckich celników, policjantów i strażników granicznych odbywają się regularnie po obu stronach granicy.

Znaczącym ustaleniem wspólnej grupy ekspertów ds. przejść granicznych jest poszerzenie przygranicznego pasa gmin, objętego przywilejami małego ruchu granicznego, o co od dawna zabiegali przedstawiciele euroregionów, zwłaszcza Euroregionu Pomerania, gdzie funkcjonują jedyne na całej granicy przejścia dla małego ruchu granicznego.

Transgraniczną komunikację ułatwiło również przedłużenie linii Uznamskiej Kolei Kąpieliskowej (Usedomer Bäder-Bahn) do granicy polskiej w Świnoujściu, a w przyszłości, w wyniku porozumienia dyrekcji Deutsche Bahn i PKP, planowane przez granicę do samego miasta.

Współpraca komend wojewódzkich policji polskiej z policją niemiecką odbywa się na podstawie umowy między rządami RP i RFN. W ramach tej współpracy prowadzone są m.in. kursy językowe w celu usprawnienia komunikacji między partnerami. Pogłębienie współpracy wymaga jednak rozwiązania wielu kwestii związanych np. z brakiem łączności radiowej między przygranicznymi jednostkami obu państw a także koncepcja tworzenia wspólnych jednostek, w których będą pracowali polscy i niemieccy policjanci czy planami wzajemnego korzystania z regionalnych baz danych (kartoteki daktyloskopijne, bazy kodów DNA).

Współpraca straży pożarnej z partnerami niemieckimi jest prowadzona już od 1993 r. na podstawie 'Porozumienia o polsko-niemieckiej współpracy przygranicznej podczas akcji straży pożarnej mających na celu obronę przed niebezpieczeństwami w rejonie przygranicznym". Porozumienie to zawarte przez województwo szczecińskie zapoczątkowało rozmowy na temat szczegółów współpracy określonych następnie "Umową między rządem RP a rządem RFN o wzajemnej pomocy podczas katastrof i klęsk żywiołowych lub innych poważnych wypadków" z 10.04.1997 r.

Również pracownicy urzędów skarbowych województwa zachodniopomorskiego i Meklemburgii-Pomorza Przedniego po wspólnym rajdzie rowerowym na trasie Dobra-Löcknitz we wrześniu 2000 r., zmierzyli swoje siły w piłce nożnej, siatkówce i przeciąganiu liny.

Przykładem współpracy planistów jest przygotowywana od kilku lat wspólna koncepcja rozwoju przestrzennego wysp Usedom/Uznam i Wolin, zakładająca obok wspólnej infrastruktury i gospodarki wodno-ściekowej, energetycznej i turystycznej, również m.in. wspólną polsko-niemiecką szkołę średnią, integracyjne imprezy kulturalno-sportowe i wydawnictwa promocyjne.

Porozumienie o współpracy pomiędzy NSZZ "Solidarność" Pomorza Zachodniego i DGB Meklemburgii-Pomorza Przedniego pn. Międzyregionalna Rada Związków Zawodowych "Pomerania" nazywane jest nawet... związkowym euroregionem. Wspólne konferencje we poświęcone są problemom rynku pracy w regionie przygranicznym i możliwościom stworzenia regionalnego transgranicznego rynku pracy.